MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 58074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_003901	GTC	2	6	4087326	4087331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229460
58002	NC_003901	AT	3	6	4087344	4087349	50 %	50 %	0 %	0 %	21229460
58003	NC_003901	TAT	2	6	4087379	4087384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229460
58004	NC_003901	T	7	7	4087390	4087396	0 %	100 %	0 %	0 %	21229460
58005	NC_003901	TTG	2	6	4087403	4087408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229460
58006	NC_003901	CCA	2	6	4087413	4087418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229460
58007	NC_003901	TCT	2	6	4087500	4087505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229460
58008	NC_003901	T	6	6	4087548	4087553	0 %	100 %	0 %	0 %	21229460
58009	NC_003901	TTTC	2	8	4087555	4087562	0 %	75 %	0 %	25 %	21229460
58010	NC_003901	TTCC	2	8	4087572	4087579	0 %	50 %	0 %	50 %	21229460
58011	NC_003901	TTA	2	6	4087637	4087642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229460
58012	NC_003901	ACC	2	6	4087652	4087657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229460
58013	NC_003901	CAT	2	6	4087764	4087769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229460
58014	NC_003901	AAT	2	6	4087827	4087832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21229461
58015	NC_003901	TAT	2	6	4087836	4087841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229461
58016	NC_003901	TGT	2	6	4087849	4087854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229461
58017	NC_003901	A	6	6	4087919	4087924	100 %	0 %	0 %	0 %	21229461
58018	NC_003901	AAG	2	6	4087947	4087952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229461
58019	NC_003901	TCTT	2	8	4088070	4088077	0 %	75 %	0 %	25 %	21229461
58020	NC_003901	TCG	2	6	4088093	4088098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229461
58021	NC_003901	TTA	2	6	4088135	4088140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229461
58022	NC_003901	T	6	6	4088203	4088208	0 %	100 %	0 %	0 %	21229461
58023	NC_003901	GGA	2	6	4088394	4088399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229461
58024	NC_003901	T	6	6	4088660	4088665	0 %	100 %	0 %	0 %	21229462
58025	NC_003901	GCA	2	6	4088698	4088703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229462
58026	NC_003901	CAT	2	6	4088744	4088749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229462
58027	NC_003901	T	6	6	4088755	4088760	0 %	100 %	0 %	0 %	21229462
58028	NC_003901	CAT	2	6	4088765	4088770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229462
58029	NC_003901	TATAT	2	10	4088832	4088841	40 %	60 %	0 %	0 %	21229462
58030	NC_003901	CT	3	6	4089053	4089058	0 %	50 %	0 %	50 %	21229462
58031	NC_003901	AGA	2	6	4089800	4089805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229463
58032	NC_003901	AT	3	6	4089933	4089938	50 %	50 %	0 %	0 %	21229463
58033	NC_003901	TAC	2	6	4090088	4090093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229463
58034	NC_003901	AGG	3	9	4090100	4090108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229463
58035	NC_003901	CGA	2	6	4090904	4090909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229464
58036	NC_003901	AGG	2	6	4091417	4091422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229465
58037	NC_003901	CGC	2	6	4091937	4091942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229466
58038	NC_003901	TTAT	2	8	4092004	4092011	25 %	75 %	0 %	0 %	21229466
58039	NC_003901	T	6	6	4092060	4092065	0 %	100 %	0 %	0 %	21229466
58040	NC_003901	AATT	2	8	4092298	4092305	50 %	50 %	0 %	0 %	21229467
58041	NC_003901	CTG	2	6	4092424	4092429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229467
58042	NC_003901	A	7	7	4092581	4092587	100 %	0 %	0 %	0 %	21229468
58043	NC_003901	GAAG	2	8	4092595	4092602	50 %	0 %	50 %	0 %	21229468
58044	NC_003901	CTT	2	6	4093525	4093530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229470
58045	NC_003901	CAA	2	6	4093880	4093885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229471
58046	NC_003901	GCC	2	6	4093898	4093903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229471
58047	NC_003901	TGAA	2	8	4094031	4094038	50 %	25 %	25 %	0 %	21229471
58048	NC_003901	ATG	2	6	4094754	4094759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229472
58049	NC_003901	TTATG	2	10	4094812	4094821	20 %	60 %	20 %	0 %	21229472
58050	NC_003901	TCT	2	6	4094841	4094846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229472
58051	NC_003901	ACT	2	6	4094895	4094900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229472
58052	NC_003901	AGA	2	6	4094908	4094913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229472
58053	NC_003901	TAA	2	6	4094969	4094974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21229472
58054	NC_003901	AAAT	2	8	4094975	4094982	75 %	25 %	0 %	0 %	21229472
58055	NC_003901	AAT	2	6	4095032	4095037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21229472
58056	NC_003901	AGG	2	6	4095138	4095143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21229472
58057	NC_003901	ATT	2	6	4095404	4095409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21229473
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58060	NC_003901	T	6	6	4095596	4095601	0 %	100 %	0 %	0 %	21229473
58061	NC_003901	TCG	2	6	4095689	4095694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229473
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.